我用的jsTree版本是3.3.3

第一个思路：直接修改jsTree源码，

这个也是我百度出来的，修改一下适合jsTree版本3.3.3

大概在5714行后面：

this.get_all_checked = function(full) {
    var tmp=new Array;
    for(var i in this._model.data){
        if(this.is_undetermined(i)||this.is_checked(i)){tmp.push(full?this._model.data[i]:i);}
    }
    return tmp;
};

使用方法：

var checkedNodes = $('#gemingcao-jstree').jstree("get_all_checked");
var checkedNodes = $('#gemingcao-jstree').jstree(true).get_all_checked();
var checkedNodes = $('#gemingcao-jstree').jstree(true).get_all_checked(true);

第二种方法：只是把放在源码里面的搬出来了。

直接对jstree实例添加get_all_checked方法，不用改动源码。使用方法一样。

$('#gemingcao-jstree').jstree(true).get_all_checked = function(full) {
    var tmp=new Array;
    for(var i in this._model.data){
        if(this.is_undetermined(i)||this.is_checked(i)){tmp.push(full?this._model.data[i]:i);}
    }
    return tmp;
};

使用方法：

var checkedNodes = $('#gemingcao-jstree').jstree("get_all_checked");
var checkedNodes = $('#gemingcao-jstree').jstree(true).get_all_checked();
var checkedNodes = $('#gemingcao-jstree').jstree(true).get_all_checked(true);